Детско-юношеската школа на „Лудогорец” съществува в този си вид едва от 7 години. Дори за този кратък срок се разви със стремителни темпове, постигна впечатляващи успехи и вече е най-проспериращата в страната.
Академията на „орлите” бързо се утвърди като марка, символ на комбинативния, нападателен, атрактивен и резултатен футбол. В нея много се разчита на високия професионализъм на треньорите, които са най-добрите в България. Академията осигурява европейски условия за подготовка и развитие на младите таланти. Тук тайните на футболната игра овладяват 200 таланти от всички краища на страната.
От сезон 2020/2021 г. Академията поддържа трети отбор – Лудогорец III, който се състезава в Североизточна Трета лига. В школата има девет формации в различните състезателни възрастови групи от U 13 до U 19 и четири подготвителни групи за деца, родени от 2009 до 2013 година. Само за седем години юношеските й отбори са се изкачвали на върха девет пъти, като са завоювали 5 шампионски титли на страната и 5 купи на БФС. Най-доброто обаче тепърва предстои.
Сезон: 2013 - 2014 / U17, (родени 1997 г.), треньор Атанас Димов
Сезон 2014 - 2015 / U15 (родени 2000 г.), треньор Радослав Комитов
Сезон 2014 - 2015 / U21, треньор Веселин Бранимиров
Сезон 2015 – 2016 / U17, (родени 1999 г.), треньор Юри Васев
Сезон 2016 – 2017 / U17, (родени 2000 г.), треньор Радослав Комитов
Сезон 2017 – 2018 / U19, (родени 2000-01 г.), треньор Юри Васев
Сезон 2016 – 2017 / U18, (родени 1999 г.), треньор Юри Васев
Сезон 2016 – 2017 / U14, (родени 2003 г.), треньор Тодор Живондов
Сезон 2018 – 2019 / U18, (родени 2001 г.), треньор Тодор Живондов
Сезон 2018 – 2019 / U16 (родени 2003 г.), треньор Иво Градев
Сезон 2019 – 2020 / U18 (родени 2002 г.), треньор Стефан Славов